Chi
Tutti i Chi
Bdellovibrio, Myxococcus, riduttori del solfato, cable bacteria e consorzi ANME-SRB un tempo riuniti fra i δ-Proteobacteria. · 18 passaggi
Campylobacterota associati agli ospiti, con confronto tra Helicobacter pylori e Campylobacter jejuni. · 18 passaggi
Enterobacterales, Pseudomonas e Vibrio, illustrati anche da Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa e Vibrio cholerae. · 18 passaggi
Le linee proteobatteriche storiche α–ε e i moduli metabolici con cui le comunità collegano azoto, zolfo, carbonio, ferro, idrogeno e ossigeno. · 18 passaggi
Le Nitrosomonadaceae betaproteobatteriche, soprattutto Nitrosomonas e Nitrosospira, confrontate con Archaea ossidatori dell’ammoniaca e comammox Nitrospira. · 18 passaggi
Le prime comunità microbiche e le linee storicamente dette Proteobacteria α–ε, compreso l’antenato batterico dei mitocondri. · 18 passaggi
Proteobacteria sensu lato come Escherichia coli, Campylobacterota e Shewanella, dotati di catene respiratorie ramificate. · 18 passaggi
Un antenato α-proteobatterico e un ospite archaeale affine agli Asgard · 18 passaggi
Come
Tutti i Come
AMO ossida NH₃ a idrossilammina, HAO e intermedi azotati portano al nitrito, mentre la catena elettronica produce energia e sostiene la fissazione della CO₂. · 18 passaggi
Catene di membrana modulari portano elettroni da donatori diversi a ossigeno o altri accettori; regolazione e scambio genico ricombinano i moduli. · 18 passaggi
Con predazione periplasmatica o sociale, vie Sat-Apr-Dsr di riduzione del solfato e trasferimenti elettronici lungo filamenti o fra partner sintrofici. · 18 passaggi
Deidrogenasi diverse alimentano pool di chinoni condivisi; sensori come FNR, ArcBA e Nar regolano uscite verso ossigeno, nitrato o altri accettori, anche extracellulari. · 18 passaggi
Endosimbiosi, trasferimento genico al nucleo e sviluppo di sistemi di importazione proteica · 18 passaggi
Mediante motilità, chemiotassi, respirazione a basso ossigeno, acclimatazione acida e uso selettivo dei nutrienti. · 18 passaggi
Un piano cellulare didermico comune viene diversificato da regolazione, metabolismo, pangenomi e trasferimento genico, producendo flessibilità redox, catabolica e acquatica. · 18 passaggi
Vie redox antiche vengono riusate e ricombinate tramite eredità verticale, duplicazioni, perdite, convergenze e trasferimenti genici orizzontali. · 18 passaggi
Dove
Tutti i Dove
In intestini, piante, suoli e acque per gli enterobatteri; in suoli, rizosfera, acque e biofilm per Pseudomonas; in particelle e ospiti acquatici per Vibrio. · 18 passaggi
In sedimenti, acque, suoli, organismi e interfacce minerali organizzati da gradienti di luce, ossigeno e substrati. · 18 passaggi
In un ecosistema microbico del Proterozoico, non identificabile con precisione · 18 passaggi
Mucosa gastrica e ambiente intestinale, confrontati con linee ambientali dello stesso ramo. · 18 passaggi
Negli antichi oceani, sedimenti, sistemi idrotermali e interfacce minerali, e oggi nei gradienti di acque, suoli, biofilm e intestini. · 18 passaggi
Nelle interfacce ossigenate di suoli, acque, sedimenti, biofilm e impianti di depurazione dove convergono ammoniaca e ossigeno. · 18 passaggi
Nelle membrane e nei periplasmi batterici, entro microambienti ossici, anossici o microaerobici di mucose, sedimenti e interfacce minerali. · 18 passaggi
Nel periplasma delle prede, sulle superfici microbiche e nei sedimenti acquatici o marini attraversati da gradienti di ossigeno, solfuro e metano. · 18 passaggi
Quando
Tutti i Quando
Durante la divergenza dei Gammaproteobacteria e nelle rapide transizioni ambientali affrontate oggi da specie e ceppi. · 18 passaggi
Durante la diversificazione dei Campylobacterota e, su scala breve, nel corso della colonizzazione dell’ospite. · 18 passaggi
Nel corso dell’evoluzione microbica profonda e ogni volta che condizioni redox variabili selezionano nuove combinazioni di vie. · 18 passaggi
Nelle comunità attuali e lungo storie evolutive indipendenti, chiarite dalla riclassificazione filogenomica moderna. · 18 passaggi
Prima dell’accumulo atmosferico di ossigeno e durante l’ossigenazione, la diversificazione batterica e l’endosimbiosi mitocondriale. · 18 passaggi
Prima dell’ultimo antenato comune degli eucarioti (LECA); datazione esatta incerta · 18 passaggi
Quando disponibilità di ossigeno, nitrato, substrati e stato redox cambiano nello spazio o nel tempo. · 18 passaggi
Quando NH₃ e O₂ sono disponibili senza livelli inibenti; un modello colloca la radiazione principale delle linee moderne intorno a centinaia di milioni di anni fa. · 18 passaggi
Perché
Tutti i Perché
Per conservare energia in ambienti redox variabili e comprendere come reti respiratorie microbiche abbiano trasformato ecosistemi e cellule eucariotiche. · 18 passaggi
Per mantenere il flusso energetico scegliendo il miglior compromesso fra rendimento, affinità, rapidità e protezione dallo stress. · 18 passaggi
Per mostrare come una parentela comune produca strategie ecologiche differenti e perché tassonomia, genoma e funzione debbano essere confrontati senza confonderli. · 18 passaggi
Per ricavare energia da coppie donatore-accettore diverse e spiegare come i metabolismi cellulari diventino cicli biogeochimici comunitari. · 18 passaggi
Per ricavare energia dall’ammoniaca e alimentare il ciclo dell’azoto, con conseguenze su fertilità, depurazione, nitrato e produzione di N₂O. · 18 passaggi
Per separare convergenza ecologica e parentela, comprendendo come microsistemi diversi controllino predazione, zolfo, metano ed elettroni. · 18 passaggi
Per sfruttare gradienti di ossigeno, pH e metaboliti e mantenere una nicchia favorevole. · 18 passaggi
Ricostruire il passaggio da simbionte batterico a organello energetico integrato · 18 passaggi
Diagramma di Venn dei passaggi collegati alle voci 5W
Cinque cerchi sovrapposti rappresentano Chi, Come, Dove, Quando e Perché. I conteggi esterni indicano i singoli insiemi, quelli nelle sovrapposizioni indicano le intersezioni e il centro mostra l’intersezione delle cinque W.
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5W
Chi
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Come
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Dove
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Perché
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Intersezioni a coppie
I conteggi comprendono anche i passaggi eventualmente presenti in altri insiemi. Seleziona una coppia per leggerli.
Chi ∩ Come
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Chi ∩ Dove
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Chi ∩ Quando
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Chi ∩ Perché
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Come ∩ Dove
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Come ∩ Quando
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Come ∩ Perché
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Dove ∩ Quando
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Dove ∩ Perché
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Quando ∩ Perché
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Chi ∩ Come ∩ Dove ∩ Quando ∩ Perché
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