Grafo del sottoalbero
Grafo 5W: Respirazione batterica nei Proteobacteria: più vie
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Come · Dove
AMO ossida NH₃ a idrossilammina, HAO e intermedi azotati portano al nitrito, mentre la catena elettronica produce energia e sostiene la fissazione della CO₂. ↔ Nelle interfacce ossigenate di suoli, acque, sedimenti, biofilm e impianti di depurazione dove convergono ammoniaca e ossigeno.
Articoli che sostengono il legame
Chi · Come
Bdellovibrio, Myxococcus, riduttori del solfato, cable bacteria e consorzi ANME-SRB un tempo riuniti fra i δ-Proteobacteria. ↔ Con predazione periplasmatica o sociale, vie Sat-Apr-Dsr di riduzione del solfato e trasferimenti elettronici lungo filamenti o fra partner sintrofici.
Articoli che sostengono il legame
Chi · Come
Campylobacterota associati agli ospiti, con confronto tra Helicobacter pylori e Campylobacter jejuni. ↔ Mediante motilità, chemiotassi, respirazione a basso ossigeno, acclimatazione acida e uso selettivo dei nutrienti.
Articoli che sostengono il legame
Come · Dove
Catene di membrana modulari portano elettroni da donatori diversi a ossigeno o altri accettori; regolazione e scambio genico ricombinano i moduli. ↔ Negli antichi oceani, sedimenti, sistemi idrotermali e interfacce minerali, e oggi nei gradienti di acque, suoli, biofilm e intestini.
Articoli che sostengono il legame
Come · Dove
Con predazione periplasmatica o sociale, vie Sat-Apr-Dsr di riduzione del solfato e trasferimenti elettronici lungo filamenti o fra partner sintrofici. ↔ Nel periplasma delle prede, sulle superfici microbiche e nei sedimenti acquatici o marini attraversati da gradienti di ossigeno, solfuro e metano.
Articoli che sostengono il legame
Come · Dove
Deidrogenasi diverse alimentano pool di chinoni condivisi; sensori come FNR, ArcBA e Nar regolano uscite verso ossigeno, nitrato o altri accettori, anche extracellulari. ↔ Nelle membrane e nei periplasmi batterici, entro microambienti ossici, anossici o microaerobici di mucose, sedimenti e interfacce minerali.
Articoli che sostengono il legame
Quando · Perché
Durante la divergenza dei Gammaproteobacteria e nelle rapide transizioni ambientali affrontate oggi da specie e ceppi. ↔ Per mostrare come una parentela comune produca strategie ecologiche differenti e perché tassonomia, genoma e funzione debbano essere confrontati senza confonderli.
Articoli che sostengono il legame
Quando · Perché
Durante la diversificazione dei Campylobacterota e, su scala breve, nel corso della colonizzazione dell’ospite. ↔ Per sfruttare gradienti di ossigeno, pH e metaboliti e mantenere una nicchia favorevole.
Articoli che sostengono il legame
Come · Dove
Endosimbiosi, trasferimento genico al nucleo e sviluppo di sistemi di importazione proteica ↔ In un ecosistema microbico del Proterozoico, non identificabile con precisione
Articoli che sostengono il legame
Chi · Come
Enterobacterales, Pseudomonas e Vibrio, illustrati anche da Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa e Vibrio cholerae. ↔ Un piano cellulare didermico comune viene diversificato da regolazione, metabolismo, pangenomi e trasferimento genico, producendo flessibilità redox, catabolica e acquatica.
Articoli che sostengono il legame
Dove · Quando
In intestini, piante, suoli e acque per gli enterobatteri; in suoli, rizosfera, acque e biofilm per Pseudomonas; in particelle e ospiti acquatici per Vibrio. ↔ Durante la divergenza dei Gammaproteobacteria e nelle rapide transizioni ambientali affrontate oggi da specie e ceppi.
Articoli che sostengono il legame
Dove · Quando
In sedimenti, acque, suoli, organismi e interfacce minerali organizzati da gradienti di luce, ossigeno e substrati. ↔ Nel corso dell’evoluzione microbica profonda e ogni volta che condizioni redox variabili selezionano nuove combinazioni di vie.
Articoli che sostengono il legame
Dove · Quando
In un ecosistema microbico del Proterozoico, non identificabile con precisione ↔ Prima dell’ultimo antenato comune degli eucarioti (LECA); datazione esatta incerta
Articoli che sostengono il legame
Chi · Come
Le linee proteobatteriche storiche α–ε e i moduli metabolici con cui le comunità collegano azoto, zolfo, carbonio, ferro, idrogeno e ossigeno. ↔ Vie redox antiche vengono riusate e ricombinate tramite eredità verticale, duplicazioni, perdite, convergenze e trasferimenti genici orizzontali.
Articoli che sostengono il legame
Chi · Come
Le Nitrosomonadaceae betaproteobatteriche, soprattutto Nitrosomonas e Nitrosospira, confrontate con Archaea ossidatori dell’ammoniaca e comammox Nitrospira. ↔ AMO ossida NH₃ a idrossilammina, HAO e intermedi azotati portano al nitrito, mentre la catena elettronica produce energia e sostiene la fissazione della CO₂.
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Chi · Come
Le prime comunità microbiche e le linee storicamente dette Proteobacteria α–ε, compreso l’antenato batterico dei mitocondri. ↔ Catene di membrana modulari portano elettroni da donatori diversi a ossigeno o altri accettori; regolazione e scambio genico ricombinano i moduli.
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Come · Dove
Mediante motilità, chemiotassi, respirazione a basso ossigeno, acclimatazione acida e uso selettivo dei nutrienti. ↔ Mucosa gastrica e ambiente intestinale, confrontati con linee ambientali dello stesso ramo.
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Dove · Quando
Mucosa gastrica e ambiente intestinale, confrontati con linee ambientali dello stesso ramo. ↔ Durante la diversificazione dei Campylobacterota e, su scala breve, nel corso della colonizzazione dell’ospite.
Articoli che sostengono il legame
Dove · Quando
Negli antichi oceani, sedimenti, sistemi idrotermali e interfacce minerali, e oggi nei gradienti di acque, suoli, biofilm e intestini. ↔ Prima dell’accumulo atmosferico di ossigeno e durante l’ossigenazione, la diversificazione batterica e l’endosimbiosi mitocondriale.
Articoli che sostengono il legame
Quando · Perché
Nel corso dell’evoluzione microbica profonda e ogni volta che condizioni redox variabili selezionano nuove combinazioni di vie. ↔ Per ricavare energia da coppie donatore-accettore diverse e spiegare come i metabolismi cellulari diventino cicli biogeochimici comunitari.
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Quando · Perché
Nelle comunità attuali e lungo storie evolutive indipendenti, chiarite dalla riclassificazione filogenomica moderna. ↔ Per separare convergenza ecologica e parentela, comprendendo come microsistemi diversi controllino predazione, zolfo, metano ed elettroni.
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Dove · Quando
Nelle interfacce ossigenate di suoli, acque, sedimenti, biofilm e impianti di depurazione dove convergono ammoniaca e ossigeno. ↔ Quando NH₃ e O₂ sono disponibili senza livelli inibenti; un modello colloca la radiazione principale delle linee moderne intorno a centinaia di milioni di anni fa.
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Dove · Quando
Nelle membrane e nei periplasmi batterici, entro microambienti ossici, anossici o microaerobici di mucose, sedimenti e interfacce minerali. ↔ Quando disponibilità di ossigeno, nitrato, substrati e stato redox cambiano nello spazio o nel tempo.
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Dove · Quando
Nel periplasma delle prede, sulle superfici microbiche e nei sedimenti acquatici o marini attraversati da gradienti di ossigeno, solfuro e metano. ↔ Nelle comunità attuali e lungo storie evolutive indipendenti, chiarite dalla riclassificazione filogenomica moderna.
Articoli che sostengono il legame
Quando · Perché
Prima dell’accumulo atmosferico di ossigeno e durante l’ossigenazione, la diversificazione batterica e l’endosimbiosi mitocondriale. ↔ Per conservare energia in ambienti redox variabili e comprendere come reti respiratorie microbiche abbiano trasformato ecosistemi e cellule eucariotiche.
Articoli che sostengono il legame
Quando · Perché
Prima dell’ultimo antenato comune degli eucarioti (LECA); datazione esatta incerta ↔ Ricostruire il passaggio da simbionte batterico a organello energetico integrato
Articoli che sostengono il legame
Chi · Come
Proteobacteria sensu lato come Escherichia coli, Campylobacterota e Shewanella, dotati di catene respiratorie ramificate. ↔ Deidrogenasi diverse alimentano pool di chinoni condivisi; sensori come FNR, ArcBA e Nar regolano uscite verso ossigeno, nitrato o altri accettori, anche extracellulari.
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Quando · Perché
Quando disponibilità di ossigeno, nitrato, substrati e stato redox cambiano nello spazio o nel tempo. ↔ Per mantenere il flusso energetico scegliendo il miglior compromesso fra rendimento, affinità, rapidità e protezione dallo stress.
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Quando · Perché
Quando NH₃ e O₂ sono disponibili senza livelli inibenti; un modello colloca la radiazione principale delle linee moderne intorno a centinaia di milioni di anni fa. ↔ Per ricavare energia dall’ammoniaca e alimentare il ciclo dell’azoto, con conseguenze su fertilità, depurazione, nitrato e produzione di N₂O.
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Chi · Come
Un antenato α-proteobatterico e un ospite archaeale affine agli Asgard ↔ Endosimbiosi, trasferimento genico al nucleo e sviluppo di sistemi di importazione proteica
Articoli che sostengono il legame
Come · Dove
Un piano cellulare didermico comune viene diversificato da regolazione, metabolismo, pangenomi e trasferimento genico, producendo flessibilità redox, catabolica e acquatica. ↔ In intestini, piante, suoli e acque per gli enterobatteri; in suoli, rizosfera, acque e biofilm per Pseudomonas; in particelle e ospiti acquatici per Vibrio.
Articoli che sostengono il legame
Come · Dove
Vie redox antiche vengono riusate e ricombinate tramite eredità verticale, duplicazioni, perdite, convergenze e trasferimenti genici orizzontali. ↔ In sedimenti, acque, suoli, organismi e interfacce minerali organizzati da gradienti di luce, ossigeno e substrati.
Articoli che sostengono il legame
Chi
8- Bdellovibrio, Myxococcus, riduttori del solfato, cable bacteria e consorzi ANME-SRB un tempo riuniti fra i δ-Proteobacteria. 1 occorrenze · 1 articoli
- Campylobacterota associati agli ospiti, con confronto tra Helicobacter pylori e Campylobacter jejuni. 1 occorrenze · 1 articoli
- Enterobacterales, Pseudomonas e Vibrio, illustrati anche da Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa e Vibrio cholerae. 1 occorrenze · 1 articoli
- Le linee proteobatteriche storiche α–ε e i moduli metabolici con cui le comunità collegano azoto, zolfo, carbonio, ferro, idrogeno e ossigeno. 1 occorrenze · 1 articoli
- Le Nitrosomonadaceae betaproteobatteriche, soprattutto Nitrosomonas e Nitrosospira, confrontate con Archaea ossidatori dell’ammoniaca e comammox Nitrospira. 1 occorrenze · 1 articoli
- Le prime comunità microbiche e le linee storicamente dette Proteobacteria α–ε, compreso l’antenato batterico dei mitocondri. 1 occorrenze · 1 articoli
- Proteobacteria sensu lato come Escherichia coli, Campylobacterota e Shewanella, dotati di catene respiratorie ramificate. 1 occorrenze · 1 articoli
- Un antenato α-proteobatterico e un ospite archaeale affine agli Asgard 1 occorrenze · 1 articoli
Come
8- AMO ossida NH₃ a idrossilammina, HAO e intermedi azotati portano al nitrito, mentre la catena elettronica produce energia e sostiene la fissazione della CO₂. 1 occorrenze · 1 articoli
- Catene di membrana modulari portano elettroni da donatori diversi a ossigeno o altri accettori; regolazione e scambio genico ricombinano i moduli. 1 occorrenze · 1 articoli
- Con predazione periplasmatica o sociale, vie Sat-Apr-Dsr di riduzione del solfato e trasferimenti elettronici lungo filamenti o fra partner sintrofici. 1 occorrenze · 1 articoli
- Deidrogenasi diverse alimentano pool di chinoni condivisi; sensori come FNR, ArcBA e Nar regolano uscite verso ossigeno, nitrato o altri accettori, anche extracellulari. 1 occorrenze · 1 articoli
- Endosimbiosi, trasferimento genico al nucleo e sviluppo di sistemi di importazione proteica 1 occorrenze · 1 articoli
- Mediante motilità, chemiotassi, respirazione a basso ossigeno, acclimatazione acida e uso selettivo dei nutrienti. 1 occorrenze · 1 articoli
- Un piano cellulare didermico comune viene diversificato da regolazione, metabolismo, pangenomi e trasferimento genico, producendo flessibilità redox, catabolica e acquatica. 1 occorrenze · 1 articoli
- Vie redox antiche vengono riusate e ricombinate tramite eredità verticale, duplicazioni, perdite, convergenze e trasferimenti genici orizzontali. 1 occorrenze · 1 articoli
Dove
8- In intestini, piante, suoli e acque per gli enterobatteri; in suoli, rizosfera, acque e biofilm per Pseudomonas; in particelle e ospiti acquatici per Vibrio. 1 occorrenze · 1 articoli
- In sedimenti, acque, suoli, organismi e interfacce minerali organizzati da gradienti di luce, ossigeno e substrati. 1 occorrenze · 1 articoli
- In un ecosistema microbico del Proterozoico, non identificabile con precisione 1 occorrenze · 1 articoli
- Mucosa gastrica e ambiente intestinale, confrontati con linee ambientali dello stesso ramo. 1 occorrenze · 1 articoli
- Negli antichi oceani, sedimenti, sistemi idrotermali e interfacce minerali, e oggi nei gradienti di acque, suoli, biofilm e intestini. 1 occorrenze · 1 articoli
- Nelle interfacce ossigenate di suoli, acque, sedimenti, biofilm e impianti di depurazione dove convergono ammoniaca e ossigeno. 1 occorrenze · 1 articoli
- Nelle membrane e nei periplasmi batterici, entro microambienti ossici, anossici o microaerobici di mucose, sedimenti e interfacce minerali. 1 occorrenze · 1 articoli
- Nel periplasma delle prede, sulle superfici microbiche e nei sedimenti acquatici o marini attraversati da gradienti di ossigeno, solfuro e metano. 1 occorrenze · 1 articoli
Quando
8- Durante la divergenza dei Gammaproteobacteria e nelle rapide transizioni ambientali affrontate oggi da specie e ceppi. 1 occorrenze · 1 articoli
- Durante la diversificazione dei Campylobacterota e, su scala breve, nel corso della colonizzazione dell’ospite. 1 occorrenze · 1 articoli
- Nel corso dell’evoluzione microbica profonda e ogni volta che condizioni redox variabili selezionano nuove combinazioni di vie. 1 occorrenze · 1 articoli
- Nelle comunità attuali e lungo storie evolutive indipendenti, chiarite dalla riclassificazione filogenomica moderna. 1 occorrenze · 1 articoli
- Prima dell’accumulo atmosferico di ossigeno e durante l’ossigenazione, la diversificazione batterica e l’endosimbiosi mitocondriale. 1 occorrenze · 1 articoli
- Prima dell’ultimo antenato comune degli eucarioti (LECA); datazione esatta incerta 1 occorrenze · 1 articoli
- Quando disponibilità di ossigeno, nitrato, substrati e stato redox cambiano nello spazio o nel tempo. 1 occorrenze · 1 articoli
- Quando NH₃ e O₂ sono disponibili senza livelli inibenti; un modello colloca la radiazione principale delle linee moderne intorno a centinaia di milioni di anni fa. 1 occorrenze · 1 articoli
Perché
8- Per conservare energia in ambienti redox variabili e comprendere come reti respiratorie microbiche abbiano trasformato ecosistemi e cellule eucariotiche. 1 occorrenze · 1 articoli
- Per mantenere il flusso energetico scegliendo il miglior compromesso fra rendimento, affinità, rapidità e protezione dallo stress. 1 occorrenze · 1 articoli
- Per mostrare come una parentela comune produca strategie ecologiche differenti e perché tassonomia, genoma e funzione debbano essere confrontati senza confonderli. 1 occorrenze · 1 articoli
- Per ricavare energia da coppie donatore-accettore diverse e spiegare come i metabolismi cellulari diventino cicli biogeochimici comunitari. 1 occorrenze · 1 articoli
- Per ricavare energia dall’ammoniaca e alimentare il ciclo dell’azoto, con conseguenze su fertilità, depurazione, nitrato e produzione di N₂O. 1 occorrenze · 1 articoli
- Per separare convergenza ecologica e parentela, comprendendo come microsistemi diversi controllino predazione, zolfo, metano ed elettroni. 1 occorrenze · 1 articoli
- Per sfruttare gradienti di ossigeno, pH e metaboliti e mantenere una nicchia favorevole. 1 occorrenze · 1 articoli
- Ricostruire il passaggio da simbionte batterico a organello energetico integrato 1 occorrenze · 1 articoli