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L.U.C.A.: popolazione ancestrale e identità filogenetica

Un nodo filogenetico non identifica una cellula osservata. Variabilità, repertori genetici e modelli di popolazione chiariscono che cosa possiamo attribuire a L.U.C.A.

Che cosa contiene il punto disegnato in un albero In un diagramma evolutivo, una popolazione vissuta per molte generazioni può essere rappresentata da un solo nodo. Il disegno comprime una storia: non conta le cellule che la componevano, non mostra tutte le varianti presenti e non identifica un individuo conservato. Questa compressione è decisiva quando si interpreta L.U.C.A., l'ultimo antenato comune universale della vita cellulare conosciuta. Il problema non consiste nello…

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Cyanobacteria: origine dei progenitori dei plastidi

Dai Gloeomargaritales all'integrazione cellulare: prove filogenomiche, trasferimento genico e importazione proteica ricostruiscono l'origine dei plastidi.

Nel nucleo di una cellula vegetale si trovano geni di ascendenza cianobatterica; le proteine che essi producono possono essere inviate al plastidio. Questa separazione fra il luogo in cui risiede un gene e quello in cui opera il suo prodotto conserva una conseguenza concreta dell'endosimbiosi: l'antico batterio è diventato parte di un sistema cellulare che distribuisce le proprie funzioni fra compartimenti. Per risalire al progenitore dei plastidi occorre affrontare due…

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Normalizzazione quantistica: dalla posizione all’impulso

La probabilità totale resta unitaria passando dalla posizione all'impulso. Fourier, numero d'onda, pacchetti gaussiani e trasformate discrete spiegano come conservare la normalizzazione senza confondere ampiezze e densità.

📐 Una norma, due rappresentazioni: posizione e impulso Uno stato quantistico normalizzato può essere descritto attraverso una funzione della posizione oppure attraverso una funzione della quantità di moto. Le due descrizioni hanno forme diverse, unità diverse e distribuzioni di probabilità diverse. Tuttavia rappresentano lo stesso stato: passando dall'una all'altra, la probabilità totale deve restare uguale a uno. Il punto da chiarire non è quindi come dividere un vettore…

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Cyanobacteria: ossigeno e rivoluzione genetica globale

Dai tappeti microbici all'atmosfera: bilanci dell'ossigeno, difese antiossidanti e risposte evolutive che trasformarono la biosfera.

Un tappeto microbico illuminato può liberare ossigeno mentre, pochi millimetri più in basso, altre cellule vivono senza utilizzarlo. Questa vicinanza fra ambienti differenti aiuta a comprendere una trasformazione che coinvolse l'intero pianeta: la produzione dei Cyanobacteria cambiò la chimica disponibile, ma le risposte biologiche si distribuirono fra organismi, habitat ed epoche diverse. Per seguire il passaggio dalla fotosintesi alla trasformazione della biosfera occorre…

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Campo inflatone: potenziale ed espansione cosmica

Il campo inflatone e la sua energia: come il potenziale può sostenere una rapida espansione dello spazio e quali tracce cerchiamo nel cielo.

L'inflazione cosmologica descrive una possibile fase in cui le distanze nell'Universo primordiale aumentarono con un'espansione accelerata. Nei modelli più semplici, a sostenere questa trasformazione è un campo fisico chiamato inflatone. Il punto da comprendere è il legame fra l'energia di questo campo e l'evoluzione dello spazio: una lenta variazione del campo può accompagnarsi a una crescita rapidissima delle distanze. Il capitolo sulla storia dell'inflazione cosmologica…

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Operatori lineari nella meccanica quantistica

Come costruire e verificare un operatore lineare: colonne della matrice, controesempi alla linearità e nucleo, con calcoli svolti su uno spazio a due dimensioni.

Un operatore lineare può essere costruito specificando che cosa fa ai vettori di una base. Questa regola permette di calcolarne l'azione su ogni loro combinazione, ma non basta a stabilire che rappresenti un'osservabile o un'evoluzione fisica. Per capire la distinzione partiamo da un calcolo a due dimensioni. Una regola sui vettori di base Fissiamo una base ortonormale {|0⟩, |1⟩} e costruiamo un esempio scegliendo liberamente i coefficienti 1, i, 2 e −1. Questi valori…

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Ciclo di Calvin e carbossisomi: evoluzione nei Cyanobacteria

Come la storia di Rubisco, il riciclo degli zuccheri fosfati e la concentrazione della CO₂ si sono intrecciati nel metabolismo dei cianobatteri.

Un cianobatterio può disporre di energia luminosa e incontrare comunque una difficoltà: fornire abbastanza anidride carbonica all'enzima che la incorpora nella materia organica. La quantità di carbonio presente nell'acqua non coincide infatti con quella immediatamente utilizzabile da Rubisco. Contano la forma chimica, il trasporto e il luogo nel quale avviene la reazione. L'evoluzione della fissazione del carbonio riguarda perciò più trasformazioni collegate: una rete di…

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Inflazione cosmologica: perché il modello di Guth cambiò

Dal falso vuoto di Guth alla nuova inflazione di Linde, Albrecht e Steinhardt: un'idea che doveva spiegare sia l'espansione accelerata sia la propria conclusione.

Nel gennaio 1981 Alan Guth pubblicò un articolo che proponeva una soluzione ai problemi dell'orizzonte e della piattezza cosmologica. Il suo abstract conteneva anche un'avvertenza: lo scenario produceva conseguenze inaccettabili e richiedeva modifiche. La difficoltà era interna al meccanismo proposto. Una fase di espansione accelerata poteva preparare condizioni favorevoli all'Universo osservabile, ma doveva poi terminare lasciando un ambiente caldo e sufficientemente…

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Origine della vita e L.U.C.A.: due problemi distinti

L'origine della vita studia l'emergere dei sistemi biologici; L.U.C.A. ne ricostruisce l'ascendenza comune. Esperimenti sulla chimica prebiotica e sull'RNA mostrano perché le due ricerche richiedano prove differenti.

Due ricerche che interrogano lo stesso passato Un laboratorio ottiene molecole utili alla costruzione dell'RNA. Un gruppo di biologi confronta genomi e ricostruisce le caratteristiche di un antenato remoto. Entrambe le ricerche riguardano la storia iniziale della vita, ma i loro risultati rispondono a domande differenti. La prima indaga come possano formarsi componenti e funzioni biologiche; la seconda cerca quali caratteri fossero presenti in una genealogia già avviata…

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Operatori e osservabili: quali esiti distinguiamo

Rietichettare, raggruppare o distinguere gli esiti: una premessa agli operatori quantistici attraverso ciò che una misura conserva e ciò che perde.

Un risultato di misura acquista significato quando sappiamo quali alternative lo strumento distingue. Registrare il segno di una grandezza, il suo valore completo o soltanto se quel valore è nullo significa conservare informazioni differenti. Prima di introdurre gli operatori, conviene fermarsi su questa scelta: quali differenze fra gli esiti vogliamo mantenere nella descrizione? Tre risultati, due modi di registrarli Costruiamo un esempio ideale con tre risultati possibili…

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Cyanobacteria: assemblaggio ed evoluzione di PSII e PSI

Come si costruiscono e si mantengono i fotosistemi dei cianobatteri, e quali relazioni fra le loro proteine permettono di ricostruirne l'evoluzione.

Come le cellule costruiscono e mantengono i fotosistemi, e quali tracce molecolari permettono di ricostruirne la storia. Un fotosistema funzionante richiede più della presenza dei geni che ne codificano le proteine. Occorre produrre i componenti, inserirli nella membrana, associare pigmenti e altri cofattori, stabilizzare gli intermedi e ottenere una configurazione capace di trasferire elettroni. Nel frattempo, le molecole che assorbono luce possono già partecipare a…

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Sovrapposizione come principio fondamentale

Spazi vettoriali e stati quantistici. Il principio di sovrapposizione: combinazioni lineari, coefficienti complessi, dipendenza dalla base e differenza rispetto a una miscela statistica.

Sovrapposizione: la regola che permette di comporre gli stati Il principio di sovrapposizione stabilisce quali nuovi stati possiamo descrivere combinando stati già ammessi. Non riguarda soltanto una figura di interferenza: appartiene alla struttura matematica della meccanica quantistica. Dopo aver introdotto spazi vettoriali, rappresentanti complessi e normalizzazione, la domanda diventa precisa: che significato fisico attribuiamo alla somma di due vettori di stato? La…

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